En el repertorio del coro Mansil Nahar figuran números de misas y motetes religiosos de autores de muy diversos estilos y épocas, siendo especialmente significativos los pertenecientes a los compositores del renacimiento español.
De manera especial se ha de resaltar aquellas misas completas (Kyrie-Gloria-Credo-Sanctus cum Benedictus-Agnus Dei) que figuran en su repertorio, como la MISA EN DO DE GOUNOD, que ha interpretado en numerosas ocasiones tanto con acompañamiento de órgano como con la orquesta Mansil Nahar.
Asimismo, en 2012 el coro estrena la MISA DE LA JORNADA MUNDIAL DE LA JUVENTUD MADRID 2011, compuesta por Kuzma Bodrov, Carlos Criado y Pedro Alfaro. La misa fue estrenada en la función solemne del Patrón de Manzanares, el día 14 de septiembre, estando el coro acompañado por las voces blancas y la Orquesta Mansil Nahar, y fue interpretada de nuevo debido a la buena acogida del público en concierto la Navidad de aquel año en el Gran Teatro de Manzanares. Con esta misa, de la que se pueden escuchar en esta página web algunos fragmentos grabados en directo durante la Eucaristía en la Parroquia de la Asunción de Nuestra Señora de Manzanares, se quiso rendir homenaje al encuentro de miles jóvenes venidos de todo el mundo a Madrid en agosto de 2011.
En septiembre de 2017, y con motivo del 75 aniversario de la llegada de la imagen de Nuestro Padre Jesús del Perdón, patrón de Manzanares, el coro estrena la MISA DEL 75 ANIVERSARIO, compuesta por el director del coro, Francisco José Román Ruiz del Moral. El libreto original de la obra fue entregado a la Hermandad de Nuestro Padre Jesús del Perdón de Manzanares como recuerdo de la efeméride.
A continuación puede escucharse una selección de fragmentos de la misa JMJ grabados en directo durante su interpretación en la Parroquia de la Asunción de Manzanares:
